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理論上，淨值和市價應該要相等或是很接近。但現實狀況中並不總是如此，當兩者價格不一致時，就出現了「折溢價」（詳見圖2）。
當淨值大於市價時，稱為折價，也就是說你買這檔ETF是用低於淨值的打折價買的。假使1檔ETF的當日淨值為50元，但市場成交價卻只有49元時，就是折價。相反的，當淨值小於市價，則稱為溢價，也就是說你用了超出這檔ETF本身應有的價值買它。同樣以ETF當日淨值為50元來說，若是市場成交價為51元，這就代表這檔ETF處於溢價。
因為每檔ETF的價格高低不同，直接比較折溢價金額並不公允，無法看出真正折溢價的程度，因此通常都是以「折價率」或是「溢價率」，也就是價差與淨值的差距比率來觀察折溢價的程度（詳見圖3）。以前述例子為例，折價率和溢價率分別是-2%和2%。
多數時候微幅的折溢價，例如在1%之內，投資人都不用太過擔心，因為一般來說，當淨值和市價出現落差時，投信公司和證券商就能透過初級與次級市場進行低買高賣的套利，使淨值和市價貼近。
但是當1檔ETF出現高溢價時，投資人就應該小心，不應該在這個時候還買進，因為高溢價代表背後目前ETF的套利功能不佳，可能市場上的交易籌碼不足，且市場上的投資人正在一窩蜂追買這檔ETF，願意付出遠高於這檔ETF淨值的金額購買，若也跟風搶在此時買進，不僅代表你買貴了，還有可能買在高點上，等到市場恢復冷靜，後續就算淨值增加，市價也不見得能夠再回到最初高溢價時的水準（查詢ETF即時折溢價的方式，詳見圖解教學➊）。
高溢價最有名的例子，就是2020年的元大S&P石油（00642U）及元大S&P原油正2（已下市）（詳見圖4）。當時由於疫情的關係，原油價格暴跌，這2檔ETF的淨值也直落，但是許多投資人卻反而抱持著「反向思考」認為這是逢低買進的機會，希望能夠搶反彈，造成元大S&P石油出現50%以上的溢價，元大S&P原油正2更是出現300%以上的溢價，等於花400元去買只有價值100元的東西，絕對是當了冤大頭。