在蔡英文當選總統前，林全是小英基金會的召集人，新總統需要一個最熟悉她政策方向的人來落實，林全自然就成了小英心中、第一任行政院長的首選。一位民進黨立委表示，蔡英文2016年1月16日當選、5月20日組閣，「林全一直到3月7日才答應當行政院長。」林全原本想「歸隱山林、當當獨董、陪陪老婆」，為了和蔡英文的情誼披掛上陣。所以民進黨立委們其實都知道，這位行政院長當了一段時間就會離開，「否則前瞻預算怎麼會開到3次臨時會，立法院幾時開3次臨時會的？」這名立委說，總不能把前瞻預算留給賴清德，知道林全想離開，「大家就幫他趕一趕這樣。」
事實上，前瞻預算確切通過的時間，沒人知道。8月30日前瞻預算在立法院過關、8月31日，蔡英文才與賴清德確定組閣時間。
根據民進黨內部人士表示，賴清德其實一直都有意願組閣，他心中最屬意的位置是國安會秘書長、或是閣揆。「他覺得他要歷練」，對賴清德來說，新北市或台北市還是在地方政府，但要歷練，就得到中央才行。
先前也傳出，可能由高雄市長陳菊組閣。但因為賴清德目前民調最高，加上考量陳菊的身體狀況和意願，所以由賴清德出線，其中一個重要的原因，民進黨認為，由賴擔任行政院長，對2018年的地方首長選舉最有幫助。
由於賴清德曾任四屆立法委員，目前在立法院的民進黨立委，有許多是他當年的同事，所以立委們認為，未來府、院的溝通，應該會比林全時代來得好。只是蔡英文和賴清德的交情，遠不如和林全，民進黨立委私下表示，蔡和賴兩人還要「學習相處」。加上賴清德是醫師出身，過去在立法院多半待在衛環，對財經議題不熟悉，也沒當過中央部會首長，所以若要「拚經濟」，「他得趕快跟上」這名立委表示。
目前蔡英文政府尚未宣布由賴清德組閣，但民進黨內部人士表示，確定由賴清德組閣，並且將在9月8日召開記者會。